O variantă de PCR care permite amplificarea specifice de secvenţă din un singur cunoscut interne secvenţă la sfârşitul fragmentul. Sursa ADN este despicat de o endonucleaze de restricție care lasă o consola, care fragmentele sunt a la un marcat sintetic universal compatibil duplex numit un vectorette. Vectorette este proiectat cu o secvenţă nepotrivite centrală, şi grund vectorette este identic cu secvenţa pe strand vectorette care devine a la acel fragment strand care poate lega un grund doua, care este complementară secvenţa interne cunoscute de fragment. Site-ul obligatoriu pentru amorsa vectorette este creat doar atunci când grund interne este extins la sfârşitul vectorette. Acest lucru evită duplicarea vectorettes ataşat la toate alte fragmente de restricţie. Un rafinament este splinkerette PCR, în care grunduri sunt concepute pentru a forma structuri de ac de păr, care scade pericolul de amorsare non-specifice.