O metodă de detectare a unei mutaţii punctul care nu produce nici distruge un site de restricţie; destinat mai ales pentru un număr mare de indivizi de screening. Unul de amorse PCR este conceput astfel încât acesta este complementară secvenţa imediat în amonte (sau în aval) de mutaţie, şi lângă său 5'-end (sau 3'-end) conţine o bază de nepotrivite. Nepotrivire şi baza mutant din apropiere (dar nu pe baza normală) atunci când amplificat genera un nou site de restricţie. Mutant amplificat ADN (spre deosebire de ADN normale amplificat), atunci când mineralizată cu endonucleaza corespunzătoare, electrophoresed şi cercetat cu un marcat etichetate adecvat, va dezvălui o nouă, mai mici restricţie fragment. Alternativ, grund nepotrivite pot fi concepute pentru a crea un nou site de restricţie cu normală, dar nu mutant, ADN-ul.