O tehnica de detectare si amplificare a ADN-ului tinta secvenţe. Doi oligodeoxynucleotides sunt sintetizate care dintre ele sunt complementare secvenţa ţintă întreaga, unul la partea 5' şi unul la partea 3'. Dacă secvenţa ţintă este prezent în probă ADN-ului examinare, antisens va obligati să-l la temperatură moderată cu capetele lor Pervaze în centru, şi o ligase de căldură-stabil i se va alătura într-un complet polinucleotide. Ligatura nu va apărea dacă secvenţa ţintă este absent sau dacă meciul dintre sintetice antisens şi secvenţa ţintă este imperfectă în regiunea unde acestea se învecina.

La o temperatură ridicată polinucleotide nou disociază din şablonul de ADN-ul original, şi la răcirea la temperatura moderata şi ADN-ul original servi ca template-uri pentru un al doilea ciclu de hibridizare, ligatura si termice disociere. La fiecare ciclu este dublarea numărului de polynucleotides complet nou, aşa că după 20 de cicluri pot exista 10 ⁶-ori amplificare. Jumătate-secvenţe pot fi construite cu markere pe capete non-ligating pentru a asista izolare (ex. biotină) sau de detectare a (exemplu o fluorophore).